Материалы и методы.Материалы и методы. Материалом для исследования послужили образцы плазмы крови 972 беременных женщин из Гвинейской Республики. Пациентки были обследованы на наличие серологических (антигенов и антител) и молекулярно-генетических маркеров (РНК) ВИЧ-инфекции. Для пациенток с положительным результатом в ПЦР и достаточной вирусной нагрузкой (>500 коп/мл) были получены генетические последовательности фрагмента гена pol, ответственные за синтез белков pro и rev, методом секвенирования по Сэнгеру. Данные последовательности были использованы для филогенетического анализа и исследованы на наличие мутаций лекарственной устойчивости.Результаты и их обсуждение. Положительными в иммуноферментном анализе (ИФА) оказалась 12,96[%] пациентов. Среди женщин, положительных в ИФА, РНК была выявлена в 76,98[%] случаев, однако в 11 случаях РНК была обнаружена у пациенток без серологических маркеров ВИЧ-инфекции, таким образом встречаемость РНК ВИЧ во всей обследованной популяции составила 11,11[%] (95[%] ДИ 9,20–13,26[%]). В подавляющем большинстве случаев обнаруживается циркулирующая рекомбинантная форма 02_AG. На основании анализа мы предполагаем значительный вклад рекомбинантных форм ВИЧ в генетическое разнообразие вируса в исследуемом регионе.Достаточно высокой оказалась встречаемость мутаций лекарственной устойчивости (ЛУ) (26,80[%]). Наиболее частыми были замены в 20 позиции протеазы (70,10[%], 95[%] ДИ 59,96–78,98[%]), из них доминирующей являлась мутация K20I. Кроме того, относительно часто встречалась мутация L10I/V, увеличивающая репликацию вирусов с другими мутациями устойчивости к ингибиторам протеазы (ИП). Среди мутаций, ассоциированных с устойчивостью ВИЧ к ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (ННИОТ), была встречена неполиморфная мутация V179T.Заключение.Заключение. Важным фактором, влияющим на эффективность профилактики передачи ВИЧ от матери к ребенку, выявленным в данной работе, являлась высокая распространенность передающейся ЛУ среди беременных женщин в Гвинее. Высокая распространенность мутаций лекарственной устойчивости, обнаруженная в этом исследовании у беременных женщин, как у ранее не получавших антиретровирусную терапию, указывает на то, что применяемые в настоящее время в Гвинее схемы лечения недостаточны для предотвращения вертикальной передачи ВИЧ-инфекции.
Greener R. AIDS and macroeconomic impact. State of The Art; AIDS and Economics // IAEN. 2002. P. 49–55.
Walker N., Grassly N.C., Gamett G.P. et al. Estimating the global burden of HIV/AIDS: What do we really know about the HIV pandemic? // Lancet. 2004. Nо. 363. P. 2180–2185. doi: 10.1016/S0140-6736(04)16511-2..
DOI: 10.1016/S0140-6736(04)16511-2
UNAIDS data 2020. UNAIDS. Jul 2020. https://www.unaids.org/en/resources/documents/2020/unaids-data.https://www.unaids.org/en/resources/documents/2020/unaids-data
Taylor B.S., Sobieszczyk M.E., McCutchan F.E. The challenge of HIV-1 subtype diversity // N. Engl. J. Med. 2008. Vol. 358. P. 1590–1602. doi: 10.1056/NEJMc086373..
DOI: 10.1056/NEJMc086373
Trover R.M., Collins K.R., Abhara A. et al. Changes in human immunodeficiency virus type 1 fitness and genetic diversity during disease progression // J. Virol. 2005. Vol. 79. P. 9006–9018. doi: 10.1128/JVI.79.14.9006-9018.2005..
DOI: 10.1128/JVI.79.14.9006-9018.2005
Sackto N., Nakasujja N., Skolasky R.L. et al. HIV subtype D is associated with dementia, compared with subtype A, in immunosuppressed individuals at risk of cognitive impairment in Kampala, Uganda // Clin. Infect. Dis. 2009. Vol. 49, No. 5. P. 780–786. doi: 10.1086/605284..
DOI: 10.1086/605284
Perno C.F., Moyle G., Tsoukas C. et al. Overcoming resistance to existing therapies in HIV-infected patients: The role of new antiretroviral drugs // J. Med. Virol. 2008. Vol. 80. P. 565–576. doi: 10.1002/jmv.21034. PMID: 18297706..
DOI: 10.1002/jmv.21034
Bobkova M.R. HIV drug resistance (Drug-resistant HIV). Moscow: Chelovek, 2014. 288 р. (In Russ.).
WHO. HIV DRUG RESISTANCE REPORT 2021 https://www.who.int/publications/i/item/9789240038608.https://www.who.int/publications/i/item/9789240038608
Aghokeng A.F., Monleau M., Eymard-Duvernay S. et al. Extraordinary heterogeneity of virological outcomes in patients receiving highly antiretroviral therapy and monitored with the World Health Organization public health approach in sub-Saharan Africa and Southeast Asia // Clin. Infect. Dis. 2014. Vol. 58. Р. 99–109; doi: 10.1093/cid/cit627..
DOI: 10.1093/cid/cit627
Boender T.S., Kityo C.M., Boerma R.S. et al. Accumulation of HIV-1 drug resistance after continued virological failure on first-line ART in adults and children in sub-Saharan Africa // J. Antimicrob Chemother. 2016. Vol. 71. Р. 2918–2927. doi: 10.1093/jac/dkw218..
DOI: 10.1093/jac/dkw218
Avila-Rios S., Garcia-Morales C., Matias-Florentino M. et al. Pretreatment HIV-drug resistance in Mexico and its impact on the effectiveness of first-line antiretroviral therapy: a nationally representative 2015 WHO survey // Lancet HIV. 2016. Vol. 3. Р. e579–e91; doi: 10.1016/S2352-3018(16)30119-9..
DOI: 10.1016/S2352-3018(16)30119-9
Bissio E., Barbás M.G., Bouzas M.B. et al. Pretreatment HIV-1 drug resistance in Argentina: results from a surveillance study performed according to WHO-proposed new methodology in 2014–15 // J. Antimicrob. Chemother. 2017. Vol. 72. Р. 504–510. doi: 10.1093/jac/dkw445..
DOI: 10.1093/jac/dkw445
Aghokeng A.F., Kouanfack C., Laurent C. et al. Scale-up of antiretroviral treatment in sub-Saharan Africa is accompanied by increasing HIV-1 drug resistance mutations in drug-naive patients // AIDS. 2011. Vol. 25. Р. 2183–2188. doi: 10.1093/jac/dkw445..
DOI: 10.1093/jac/dkw445
Chung M.H., Silverman R., Beck I.A. et al. Increasing HIV-1 pretreatment drug resistance among antiretroviral-naïve adults initiating treatment between 2006 and 2014 in Nairobi, Kenya // AIDS. 2016. Vol. 30. Р. 1680–1682. doi: 10.1097/QAD.0000000000001110..
DOI: 10.1097/QAD.0000000000001110
Gupta R.K., Gregson J., Parkin N. et al. HIV-1 drug resistance before initiation or re-initiation of first-line antiretroviral therapy in low-income and middle-income countries: a systematic review and meta-regression analysis // Lancet Infect Dis. 2018. Vol. 18. Р. 346–355. doi: 10.1016/S1473–3099(17)30702-8..
DOI: 10.1016/S1473–3099(17)30702-8
Bekolo C.E., Soumah M.M., Tiemtore O.W. et al. Assessing the outcomes of HIV-infected persons receiving treatment for Kaposi sarcoma in Conakry-Guinea // BMC Cancer. 2017. Vol. 17, No. 1. Р. 806. doi: 10.1186/s12885-017-3771-x..
DOI: 10.1186/s12885-017-3771-x
Bbosa N., Kaleebu P., Ssemwanga D. HIV subtype diversity worldwide // Curr. Opin HIV AIDS. 2019. Vol. 14, No. 3. Р. 153–160. doi: 10.1097/COH.0000000000000534..
DOI: 10.1097/COH.0000000000000534
Lihana R.W., Ssemwanga D., Abimiku A., Ndembi N. Update on HIV-1 diversity in Africa: a decade in review // AIDS Rev. 2012. Vol. 14. Р. 83–100.
Nii-Trebi N.I., Brandful J.A.M., Ibe S. et al. Dynamic HIV-1 genetic recombination and genotypic drug resistance among treatment-experienced adults in northern Ghana // J. Med Microbiol. 2017. Vol. 66, No. 11. Р. 1663–1672. doi: 10.1099/jmm.0.000621..
DOI: 10.1099/jmm.0.000621
Shchemelev A.N., Boumbaly S., Ostankova Y.V. et al. Prevalence of drug resistant HIV-1 forms in patients without any history of antiretroviral therapy in the Republic of Guinea // J. Med. Virol. 2023. Jan; Vol. 95, No. 1. e28184. doi: 10.1002/jmv.28184. Epub 2022 Oct 6. PMID: 36175006..
DOI: 10.1002/jmv.28184. Epub 2022 Oct 6
Mugo N.R., Heffron R., Donnell D. et al. Increased risk of HIV-1 transmission in pregnancy: a prospective study among African HIV-1-serodiscordant couples // AIDS. 2011. Vol. 25. Р. 1887–1895. doi: 10.1097/QAD.0b013e32834a9338..
DOI: 10.1097/QAD.0b013e32834a9338
Sheffield J.S., Wendel G.D.J., McIntire D.D., Norgard M.V. The effect of progesterone levels and pregnancy on HIV-1 coreceptor expression // Reprod. Sci. 2009. Vol. 16. Р. 20–31. doi: 10.1177/1933719108325510..
DOI: 10.1177/1933719108325510
Weiser S.D., Young S.L., Cohen C.R. et al. Conceptual framework for understanding the bidirectional links between food insecurity and HIV/AIDS // Am. J. Clin. Nutr. 2011. Vol. 94. Р. 1729S–1739S. doi: 10.3945/ajcn.111.012070..
DOI: 10.3945/ajcn.111.012070
UNAIDS. UNAIDS 2019 Data [Internet]. Joint United Nations Programme on HIV/AIDS (UNAIDS). 2019. Р. 1–248. Available.
Weiser S.D., Leiter K., Bangsberg D.R. et al. Food insufficiency is associated with high-risk sexual behavior among women in Botswana and Swaziland // PLoS Med. 2007. Vol. 4. Р1589–1597. doi: 10.1371/journal.pmed.0040260. from: https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/2019-UNAIDS-data_en.pdf..
DOI: 10.1371/journal.pmed.0040260. from:https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/2019-UNAIDS-data_en.pdf
World Health Organization (WHO). Antiretroviral Therapy for HIV Infection in Adults and Adolescents: Recommendations for a Public Health Approach: 2010 Revision. 2010. P. 14. from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK138528.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK138528
Diouara A.A., Ndiaye H.D., Guindo I. et al. Antiretroviral treatment outcome in HIV-1-infected patients routinely followed up in capital cities and remote areas of Senegal, Mali and Guinea-Conakry // J. Int. AIDS Soc. 2014. Dec 18; Vol. 17, No. 1. Р; 19315. doi: 10.7448/IAS.17.1.19315..
DOI: 10.7448/IAS.17.1.19315
Start Free, Stay Free, AIDS Free [website]. Geneva: UNAIDS; 2020 [cited: 21/12/20]. from: https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/Stay_free_vision_mission_En.pdf.https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/Stay_free_vision_mission_En.pdf
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecular Biology and Evolution. 2016. Vol. 33, No. 7. P. 1870–1874. doi: 10.1093/molbev/msw054..
DOI: 10.1093/molbev/msw054
Vingerhoets J., Peeters M., Azijn H. et al. An update of the list of NNRTI mutations associated with decreased virological response to etravirine: multivariate analyses on the pooled DUET-1 and DUET-2 clinical trial data [abstract 24] // Antiviral Therapy. 2008. Vol. 13, Suppl. 3. A26.
Flor-Parra F., Pérez-Pulido A.J., Pachón J., Pérez-Romero P. The HIV type 1 protease L10I minor mutation decreases replication capacity and confers resistance to protease inhibitors // AIDS Res Hum Retroviruses. 2011; Vol. 27, No. 1. Р. 65–70; doi: 10.1089/aid.2010.0072..
DOI: 10.1089/aid.2010.0072
Barnard J.P., Huber K.D., Sluis-Cremer N. Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor Hypersusceptibility and Resistance by Mutation of Residue 181 in HIV-1 Reverse Transcriptase // Antimicrob. Agents Chemother. 2019. Jul 25; Vol. 63, No. 8. Р. e00676–19; doi: 10.1128/AAC.00676-19..
DOI: 10.1128/AAC.00676-19
Tambuyzer L., Azijn H., Rimsky L.T. et al. Compilation and prevalence of mutations associated with resistance to non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors // Antivir. Ther. 2009. Vol. 14, No. 1. Р. 103–109.
Moorhouse M., Maartens G., Venter W.D.F. et al. Third-Line Antiretroviral Therapy Program in the South African Public Sector: Cohort Description and Virological Outcomes // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2019. Jan 1; Vol. 80, No. 1. Р. 73–78. doi: 10.1097/QAI.0000000000001883..
DOI: 10.1097/QAI.0000000000001883
Mo H., King M.S., King K. et al. Selection of resistance in protease inhibitor-experienced, human immunodeficiency virus type 1-infected subjects failing lopinavirand ritonavir-based therapy: mutation patterns and baseline correlates // J. Virol. 2005. Vol. 79. Р. 3329–3338. 10.1128/JVI.79.6.3329-3338.2005.
Yendewa G.A., Sahr F., Lakoh S. et al. Prevalence of drug resistance mutations among ART-naive and -experienced HIV-infected patients in Sierra Leone // J. Antimicrob. Chemother. 2019. Vol. 74, No. 7. Р. 2024–2029.
Boyce C.L., Sils T., Ko D. et al. Maternal Human Immunodeficiency Virus (HIV) Drug Resistance Is Associated With Vertical Transmission and Is Prevalent in Infected Infants // Clin. Infect. Dis. 2022. Jun 10; Vol. 74, No. 11. Р. 2001–2009. doi: 10.1093/cid/ciab744..
DOI: 10.1093/cid/ciab744
World Health Organization. Update of Recommendations on First- and Second-Line Antiretroviral Regimens Geneva, Switzerland: World Health Organization, 2019. Report No: Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.
Scarsi K.K., Havens J.P., Podany A.T. et al. HIV-1 Integrase Inhibitors: A Comparative Review of Efficacy and Safety // Drugs. 2020. Nov; Vol. 80, No. 16. Р. 1649–1676. doi: 10.1007/s40265-020-01379-9..
DOI: 10.1007/s40265-020-01379-9