Опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ
В работе описан первый опыт использования геномного анализа в условиях мобильного комплекса СПЭБ во время проведения XXVII Всемирной летней Универсиады-2013 в Казани. В результате было проведено 16S рРНК секвенирование штамма Salmonella enterica , выделенного от больного. Для этого использовали набор «MicroSEQ 500 16S rDNA Bacterial Identification Kits» (Applied Biosystems, США), позволяющий секвенировать фрагменты ДНК (500 пар нуклеотидов) гена 16S рРНК исследуемых бактерий.
Baddam R., Thong K.L., Avasthi T.S., Shaik S., Yap K.P., Teh C.S., Chai L.C., Kumar N., Ahmed N. Whole-genome sequences and comparative genomics of Salmonella enterica serovar Typhi isolates from patients with fatal and nonfatal typhoid fever in Papua New Guinea. J. Bacteriol. 2012; 194:5122-3.
Guibourdenche M., Roggentin P., Mikoleit M., Fields P.I., Bockemühl J., Grimont P.A.D., Weill F.-X. Supplement 2003-2007 (No. 47) to the White-Kauffmann-Le Minor scheme. Res. Microbiol. 2010; 161:26-9.
Hellberg R.S., Haney C.J., Shen Y., Cheng C.M., Williams-Hill D.M., Martin W.B. Development of a custom 16S rRNA gene library for the identification and molecular subtyping of Salmonella enterica. J. Microbiol. Methods. 2012; 91(3):448-58.
Hendriksen R.S. A global Salmonella surveillance and laboratory support project of the World Health Organization. 4th Ed. April 2003.
Язык текста: Русский
ISSN: 0370-1069