Анализ стабильности генотипа Vibrio cholerae в условиях низкой температуры и дефицита питательных веществ

СтатьяПРОБ ОСОБ ОПАС ИНФ. 2016; № 3: 52–56. DOI:10.21055/0370-1069-2016-3-52-56

Миронова Л.В.^[1]

Хунхеева Ж.Ю.^[1]

Басов Е.А.^[1]

Пономарева А.С.^[1]

Миткеева С.К.^[1]

Балахонов С.В.^[1]

^[1]Иркутский научно-исследовательский противочумный институт

Цель работы.Цель работы. Экспериментальное исследование влияния низкой температуры и дефицита питательных веществ на стабильность комплекса генетических локусов Vibrio cholerae Еltor.Материалы и методы.Материалы и методы. В экспериментальных микрокосмах исследовалась стабильность комплекса генетических локусов (основные гены патогенности; участки генома, содержащие вариабельные тандемные повторы и сайты узнавания редкощепящих рестриктаз, определяющие VNTR- и PFGE-профиль изолятов соответственно; гены жизнеобеспечения холерного вибриона) четырех штаммов Vibrio cholerae Еltor на разных этапах инкубации.Результаты и выводы.Результаты и выводы. Установлено, что при культивировании исследуемых штаммов в условиях дефицита питательных веществ и низкой температуры произошло формирование клонов с измененным VNTR- и PFGE-профилями, частота обнаружения которых составила 4–8·10–2. Изменений в структуре генов «домашнего хозяйства» и утраты генов патогенности в составе мобильных генетических элементов не выявлено. Результаты исследования доказывают вероятность изменения анализируемых локусов генома V. cholerae в период пребывания микроорганизма в неблагоприятных условиях среды, что следует принимать во внимание при интерпретации результатов молекулярного типирования.

Vibrio cholerae

стабильность генотипа

адаптация

VNTR

PFGE

гены «домашнего хозяйства»

гены патогенности

Salmonella enterica

Белки

Внимание

Генетический локус

Генотип

Гены

Инфекции

Методы

Молекулярное типирование

Нуклеиновых кислот последовательности повторяющиеся

Нутриенты

Питательность

Работа

Температура

Холерные вибрионы

Элементы

Бельский В.А., Калуцкий П.В., Киселева В .В., Шаталова Е.В., Закарян Л.М. Гетерогенность микробных популяций. М.: Медицинское информационное агентство; 2008. 160 с.

Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю., Мишанькин Б.Н. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология. 2001; 6:85–8.

Красильников А.П., Романовская Т.Р. Микробиологический словарь-справочник. Минск: Асар; 1999. 397 с.

Кульшань Т.В., Топорков А.В., Смирнова Н.И. Генетические изменения вирулентных штаммов холерных вибрионов биовара Эльтор при их обитании в водной среде. Пробл. особо опасных инф. 2006; 1(91):41–4.

Кульшань Т.В., Заднова С.П., Челдышова Н.Б., Смирнова Н.И. Оценка функциональных особенностей и стрессоустойчивости изогенных токсигенных и нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара эльтор. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2015; 3:11–7.

Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я., Кожевникова А.С., Половинкина В.С., Куликалова Е.С., Афанасьев М.В. Молекулярно-генетический анализ заносных эпидемически опасных штаммов Vibrio cholerae eltor, изолированных в Сибирском и Дальневосточном регионах России. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2012; 2:13–20.

Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Басов Е.А., Урбанович Л.Я., Балахонов С.В. Ретроспективный макрорестрикционный анализ штаммов Vibrio cholerae eltor, изолированных при эпидемических осложнениях на Дальнем Востоке России. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2014; 2:29–36.

Равин Н.В., Шестаков С.В. Геном прокариот. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013; 17(4/2):972–84.

Смирнов Г.Б. Механизмы приобретения и потери генетической информации бактериальными геномами. Усп. современной биол. 2008; 128(1):52–76.

Andersson D.I., Hughes D. Gene Amplification and Adaptive Evolution in Bacteria. Annu. Rev. Genet. 2009; 43:167–95. DOI: 10.1146/annurev-genet-102108-134805..
DOI: 10.1146/annurev-genet-102108-134805

Barua H., Lindblom I.L., Bisgaard M., Сhristensen J.P., Olsen R.H., Christensen H. In vitro and in vivo investigation on genomic stability of Salmonella enterica Typhimurium DT41 obtained from broiler breeders in Denmark. Vet. Microbiol. 2013; 166:607–16. DOI: 10.1016/j.vetmic.2013.06.035..
DOI: 10.1016/j.vetmic.2013.06.035

Jubair M., Morris J.G. Jr., Ali A. Survival of Vibrio cholerae in nutrient-poor environments is associated with a novel «persister » phenotype. PLoS One. 2012;7(9). DOI: 10.1371/journal. pone.0045187..
DOI: 10.1371/journal. pone.0045187

Jubair M., Morris J.G. Jr., Ali A. Survival of Vibrio cholerae in nutrient-poor environments is associated with a novel «persister » phenotype. PLoS One. 2012;7(9). DOI: 10.1371/journal. pone.0045187..
DOI: 10.1371/journal.pone.0045187

Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y., Khan A.I., Li S., Thierer J.H., Bailey J., Kreisel K., Tacket C.O., LaRocque R.C., Harris J.B., Ryan E.T., Qadri F., Calderwood S.B., Stine O.C. Relatedness of Vibrio cholerae O1/O139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus variable-number tandem-repeat analysis. J. Bacteriol. 2010; 192(17):4367–76. DOI: 10.1128/JB.00698-10..
DOI: 10.1128/JB.00698-10

O’Sullivan M.V.N., Sintchenko V., Gilbert G.L. Quantitative Estimation of the Stability of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Strain-Typing Systems by Use of Kaplan-Meier Survival Analysis. J. Clin. Microbiol. 2013; 51(1):112–16. DOI: 10.1128/ JCM.01406-12..
DOI: 10.1128/ JCM.01406-12

O’Sullivan M.V.N., Sintchenko V., Gilbert G.L. Quantitative Estimation of the Stability of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Strain-Typing Systems by Use of Kaplan-Meier Survival Analysis. J. Clin. Microbiol. 2013; 51(1):112–16. DOI: 10.1128/ JCM.01406-12..
DOI: 10.1128/JCM.01406-12

Talkington D., Bopp C., Tarr C., Parsons M.B., Dahourou G., Freeman M., Joyce K., Turnsek M., Garrett N., Humphrys M., Gomez G., Stroika S., Boncy J., Ochieng B., Oundo J., Klena J., Smith A., Keddy K., Gerner-Smidt P. Characterization of toxigenic Vibrio cholerae from Haiti, 2010–2011. Emerg. Infect. Dis. 2011; 17(11):2122–9. DOI: 10.3201/eid1711.110805..
DOI: 10.3201/eid1711.110805

Язык текста: Русский

ISSN: 0370-1069