Результаты выявления SARS-CoV-2 и других возбудителей внебольничных пневмоний методом ПЦР в Тюменской области

СтатьяПРОБ ОСОБ ОПАС ИНФ. 2020; № 3: 146–149. DOI:10.21055/0370-1069-2020-3-146-149

Бакштановская И.В.^[1]

Степанова Т.Ф.^[1]

Шарухо Г.В.^[2]

Летюшев А.Н.^[1,2]

Степанова К.Б.^[1]

Логинова Н.В.^[3]

Панина Ц.А.^[1]

Зматракова Е.А.^[1]

Косырева А.Н.^[1]

Бартусевич А.З.^[1]

Леонтьева С.А.^[1]

Вишнякова А.О.^[1]

^[1]Тюменский НИИ краевой инфекционной патологии

^[2]Управление Роспотребнадзора по Тюменской области

^[3]Департамент здравоохранения Тюменской области

Материалы и методы.Материалы и методы. Проведено исследование 268 проб от 258 пациентов методом ПЦР для выявления РНК /ДНК возбудителей респираторных инфекций вирусной и бактериальной природы.Результаты и обсуждение.Результаты и обсуждение. В 43,3 [%] проб выявлена РНК SARS-CoV-2, в 4,5 [%] – РНК /ДНК возбудителей ОРВИ , в одной пробе – ДНК Mycoplasma pneumoniae. Ко-инфекция обнаружена только у пациентов противотуберкулезного диспансера (SARS-CoV-2 с микобактериями туберкулеза). У обследованных больных пневмонией РНК SARS-CoV-2 существенно чаще выявлялась в биоматериале из нижних дыхательных путей (52 [%]), чем в респираторных мазках (8,5 [%]). В первую неделю от начала заболевания обнаружено 19,2 [%] положительных проб, во вторую – 56,5 [%].

пневмония

ПЦР

SARS-CoV-2

ко-инфекции

Adenoviridae

COVID-19

Mycoplasma pneumoniae

Paramyxoviridae инфекции

SARS-CoV-2

Амбулаторно-поликлинические учреждения

Биосовместимые материалы

Больные

Грипп человека

Данных сбор

Диагностика дифференциальная

Коинфекция

Методы

Микобактерии туберкулеза

Полимеразная цепная реакция

Природа

РНК

Риновирус

Туберкулез

Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Корита Т.В., Балахонцева Л.А., Котова В.О. 2020. Особенности пневмоний, вызванных новым коронавирусом SARS-CoV-2 (Обзор литературы). COVID19- PREPRINTS.MICROBE.RU. 23.07.2020. [Электронный ресурс]. DOI: 10.21055/preprints-3111730..
DOI: 10.21055/preprints-3111730

Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266–75. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046..
DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046

Kim D., Quinn J., Pinsky B., Shah N.H., Brown I. Rates of co-infection between SARS-CoV-2 and other respiratory pathogens. JAMA. 2020; 323(20):2085–86. DOI: 10.1001/jama.2020.6266..
DOI: 10.1001/jama.2020.6266

Хафизов К.Ф., Сперанская А.С., Мацвай А.Д., Шипулин Г.А., Дедков В.Г. Передовые технологии в диагностике вирусных заболеваний неясной этиологии. Инфекция и иммунитет. 2020; 10(1):9–25.

Александрович Ю.С., Байбарина Е.Н., Баранов А.А., Вишнева Е.А., Зверева Н.Н., Иванов Д.О., Крючко Д.С., Коновалов И.В., Куличенко Т.В., Лобзин Ю.В., Мазанкова Л.Н., Намазова-Баранова Л.С., Петренко Ю.В., Прометной Д.В., Пшениснов К.В., Ртищев А.Ю., Сайфуллин М.А., Селимзянова Л.Р., Усков А.Н., Федосеенко М.В., Харькин А.В., Чумакова О.В., Эфендиева К.Е., Яковлев А.В. Ведение детей с заболеванием, вызванным новой коронавирусной инфекцией (SARSCoV-2). Педиатрическая фармакология. 2020; 17(2):103–18. DOI: 10.15690/pf.v17i2.2096..
DOI: 10.15690/pf.v17i2.2096

Катаева Л.В., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б., Бакштановская И.В., Посоюзных О.В., Ташланова В.В., Карпухина Н.Ф., Колотова О.Н., Калашникова Ю.Н., Вакарина А.А. Микробиоценоз нижних дыхательных путей при пневмонии, ассоциированной с SARS-CoV-2. COVID19-PREPRINTS.MICROBE.RU. 29.07.2020. [Электронный ресурс]. DOI: 10.21055/preprints-3111755..
DOI: 10.21055/preprints-3111755

Lu X., Wang L., Sakthivel S.K., Whitaker B., Murray J., Kamili S., Lynch B., Malapati L., Burke S.A., Harcourt J., Tamin A., Thornburg N.J., Villanueva J.M., Lindstrom S. US CDC Real-Time Reverse Transcription PCR Panel for Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg. Infect. Dis. 2020; 26(8):1654–65. DOI: 10.3201/eid2608.201246..
DOI: 10.3201/eid2608.201246

Язык текста: Русский

ISSN: 0370-1069