Спицын А.Н., Уткин Д.В., Куклев В.Е., Портенко С.А., Германчук В.Г., Осина Н.А. Применение MALDI массспектрометрии в диагностике особо опасных инфекционных болезней: современное состояние и перспективы. Проблемы особо опасных инфекций. 2014; 3:77–82. DOI: 10.21055/0370-1069-2014-3-77-82..
DOI: 10.21055/0370-1069-2014-3-77-82

Lasch P., Grunow R., Antonation K., Weller S.A., Jacob D. Inactivation techniques for MALDI-TOF MS analysis of highly pathogenic bacteria – A critical review. TrAC – Trend. Anal. Chem. 2016; 85:112–119. DOI: 10.1016/j.trac.2016.04.012..
DOI: 10.1016/j.trac.2016.04.012

Lasch P., Jacob D., Grunow R., Schwecke T., Doellinger J. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry (MS) for the identification of highly pathogenic bacteria. TrAC – Trend. Anal. Chem. 2016; 85:103–111. DOI: 10.1016/j.trac.2016.04.013..
DOI: 10.1016/j.trac.2016.04.013

Wigmann E.F., Behr J., Vogel R.F., Niessen L. MALDI-TOF MS fingerprinting for identification and differentiation of species within the Fusarium fujikuroi species complex. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2019; 103(13):5323–5337. DOI: 10.1007/s00253-019-09794-z..
DOI: 10.1007/s00253-019-09794-z

Останкова Ю.В., Семенов А.В., Зуева Е.В., Вашукова М.А., Тотолян А.А. Идентификация Stenotrophomonas maltophilia с использованием методов прямого секвенирования 16s рРНКи MALDI-TOF масс-спектрометрии. Клиническая лабораторная диагностика. 2017; 62(3):165–170. DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-3-165-170..
DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-3-165-170

Телесманич Н.Р., Чайка С.О., Чайка И.А., Гончаренко Е.В., Ломов Ю.М. Масс-спектрометрический анализ MALDI-TOF в идентификации и типировании штаммов холерных вибрионов. Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61(6):375–379. DOI: 10.18821/0869-2084-2016-6-375-379..
DOI: 10.18821/0869-2084-2016-6-375-379

Шаров Т.Н., Червакова М.П., Баркова И.А., Барков А.М., Викторов Д.В., Топорков А.В. Проблемы идентификации различных штаммов вегетативной формы Bacillus anthracis методом MALDI-TOF MS. Клиническая лабораторная диагностика. 2017; 62(5):316–318. DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-3-316-318..
DOI: 10.18821/0869-2084-2017-62-3-316-318

Sun L., Teramoto K., Sato H., Torimura M., Tao H., Shintani T. Characterization of ribosomal proteins as biomarkers for matrix‐assisted laser desorption/ionization mass spectral identification of Lactobacillus plantarum. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006; 20(24):3789–3798. DOI: 10.1002/rcm.2801..
DOI: 10.1002/rcm.2801

Suarez S., Ferroni A., Lotz A., Jolley K.A., Guérin P., Leto J., Dauphin B., Jamet A., Maiden M.C., Nassif X., Armengaud J. Ribosomal proteins as biomarkers for bacterial identification by mass spectrometry in the clinical microbiology laboratory. J. Microbiol. Methods. 2013; 94(3):390–396. DOI: 10.1016/j.mimet.2013.07.021..
DOI: 10.1016/j.mimet.2013.07.021

Croxatto A., Prod’hom G., Greub G. Applications of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical diagnostic microbiology. FEMS Microbiol. Rev. 2012; 36(2):380–407. DOI:10.1111/j.1574-6976.2011.00298.x..
DOI: 10.1111/j.1574-6976.2011.00298.x

Grunow R., Jacob D., Klee S. Schlembach D., JackowskiDohrmann S., Loenning-Baucke V., Eberspächer B., Swidsinski S. Brucellosis in a refugee who migrated from Syria to Germany and lessons learnt, 2016. Euro Surveill. 2016; 21(31):30311. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2016.21.31.30311..
DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2016.21.31.30311

Mesureur J., Arend S., Cellière B., Courault P., Cotte-Pattat P.J., Totty H., Deol P., Mick V., Girard V., Touchberry J., Burrowes V., Lavigne J.P., O’Callaghan D., Monnin V., Keriel A. A MALDI-TOF MS database with broad genus coverage for species-level identification of Brucella. PLoS Negl. Trop. Dis. 2018; 12(10):e0006874. DOI: 10.1371/journal.pntd.0006874..
DOI: 10.1371/journal.pntd.0006874

Sali M., De Maio F., Tarantino M., Garofolo G., Tittarelli M., Sacchini L., Zilli K., Pasquali P., Petrucci P., Marianelli C., Francia M., Sanguinetti M., Adone R. Rapid and safe one-step extraction method for the identification of Brucella strains at genus and species level by MALDI-TOF mass spectrometry. PLoS One. 2018; 13(6):e0197864. DOI: 10.1371/journal.pone.0197864..
DOI: 10.1371/journal.pone.0197864

Ishihama Y., Schmidt T., Rappsilber J., Mann M., Hartl F.U., Kerner M.J., Frishman D. Protein abundance profiling of the Escherichia coli cytosol. BMC Genomics. 2008; 9:102. DOI: 10.1186/1471-2164-9-102..
DOI: 10.1186/1471-2164-9-102

Hsieh S.Y., Tseng C.L., Lee Y.S., Kuo A.J., Sun C.F., Lin Y.H., Chen J.K. Highly efficient classification and identification of human pathogenic bacteria by MALDI-TOF MS. Mol. Cell. Proteomics. 2008; 7(2):448–456. DOI: 10.1074/mcp.M700339-MCP200..
DOI: 10.1074/mcp.M700339-MCP200

Faron M.L., Buchan B.W., Ledeboer N.A. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry for use with positive blood cultures: methodology, performance, and optimization. J. Clin. Microbiol. 2017; 55(12):3328–3338. DOI: 10.1128/JCM.00868-17..
DOI: 10.1128/JCM.00868-17

Wei J., Zhang H., Zhang H., Zhang E., Zhang B., Zhao F., Xiao D. Novel strategy for rapidly and safely distinguishing Bacillus anthracis and Bacillus cereus by use of peptide mass fingerprints based on matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Clin. Microbiol. 2020; 59(1):02358-20. DOI: 10.1128/JCM.02358-20..
DOI: 10.1128/JCM.02358-20

Ayyadurai S., Flaudrops C., Raoult D., Drancourt M. Rapid identification and typing of Yersinia pestis and other Yersinia species by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry. BMC Microbiol. 2010; 10:285. DOI: 10.1186/1471-2180-10-285..
DOI: 10.1186/1471-2180-10-285

Sonthayanon P., Jaresitthikunchai J., Mangmee S., Thiangtrongjit T., Wuthiekanun V., Amornchai P., Newton P., Phetsouvanh R., Day N.P., Roytrakul S. Whole cell matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) for identification of Leptospira spp. in Thailand and Lao PDR. PLoS Negl. Trop. Dis. 2019; 13(4):e0007232. DOI: 10.1371/journal.pntd.0007232..
DOI: 10.1371/journal.pntd.0007232

Зуева Е.В., Стоянова Н.А., Токаревич Н.К., Тотолян Ар.А. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ штаммов Leptospira spp., используемых в серодиагностике лептоспироза. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015; 6:28–36.

Rettinger A., Krupka I., Grünwald K., Dyachenko V., Fingerle V., Konrad R., Raschel H., Busch U., Sing A., Straubinger R.K., Huber I. Leptospira spp. strain identification by MALDI TOF MS is an equivalent tool to 16S rRNA gene sequencing and multi locus sequence typing (MLST). BMC Microbiol. 2012; 12:185. DOI: 10.1186/1471-2180-12-185..
DOI: 10.1186/1471-2180-12-185

Tomachewski D., Galvão C.W., de Campos Júnior A., Guimarães A.M., Ferreira da Rocha J.C., Etto R.M. Ribopeaks: a web tool for bacterial classification through m/z data from ribosomal proteins. Bioinformatics. 2018; 34(17):3058–3060. DOI: 10.1093/bioinformatics/bty215..
DOI: 10.1093/bioinformatics/bty215

Alnakip M.E., Rhouma N.R., Abd-Elfatah E.N., QuintelaBaluja M., Böhme K., Fernández-No I., Barros-Velázquez J. Discrimination of major and minor streptococci incriminated in bovine mastitis by MALDI-TOF MS fingerprinting and 16S rRNA gene sequencing. Res. Vet. Sci. 2020; 132:426–438. DOI: 10.1016/j.rvsc.2020.07.027..
DOI: 10.1016/j.rvsc.2020.07.027

El-Jeni R., Böhme K., El Bour M., Calo-Mata P., Kefi R., Barros-Velázquez J., Bouhaouala-Zahar B. Rapid genus identification of selected lactic acid bacteria isolated from Mugil cephalis and Oreochromis niloticus organs using MALDI-TOF. Ann. Microbiol. 2019; 69(1):1–15. DOI: 10.1007/s13213-018-1357-8..
DOI: 10.1007/s13213-018-1357-8

Torres-Corral Y., Fernández-Álvarez C., Santos Y. Proteomic and molecular fingerprinting for identification and tracking of fish pathogenic Streptococcus. Aquaculture. 2019; 498:322–334. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2018.08.041..
DOI: 10.1016/j.aquaculture.2018.08.041

Christoforidou S., Kyritsi M., Boukouvala E., Ekateriniadou L., Zdragas A., Samouris G., Hadjichristodoulou C. Identification of Brucella spp. isolates and discrimination from the vaccine strain Rev. 1 by MALDI-TOF mass spectrometry. Mol. Cell. Prob. 2020; 51:101533. DOI: 10.1016/j.mcp.2020.101533..
DOI: 10.1016/j.mcp.2020.101533

Kyritsi M.A., Kristo I., Hadjichristodoulou C. Serotyping and detection of pathogenecity loci of environmental isolates of Legionella pneumophila using MALDI-TOF MS. Int. J. Hyg. Environ. Health. 2020; 224:113441. DOI: 10.1016/j.ijheh.2019.113441..
DOI: 10.1016/j.ijheh.2019.113441

Torres I., Giménez E., Vinuesa V., Pascual T., Moya J.M., Alberola J., Martínez-Sapiña A., Navarro D. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDITOF-MS) proteomic profiling of cerebrospinal fluid in the diagnosis of enteroviral meningitis: a proof-of-principle study. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2018; 37(12):2331–39. DOI: 10.1007/s10096-018-3380-x..
DOI: 10.1007/s10096-018-3380-x

Martina P., Leguizamon M., Prieto C.I., Sousa S.A., Montanaro P., Draghi W.O., Stämmler M., Bettiol M., de Carvalho C.C.C.R., Palau J., Figoli C., Alvarez F., Benetti S., Lejona S., Vescina C., Ferreras J., Lasch P., Lagares A., Zorreguieta A., Leitão J.H., Yantorno O.M., Bosch A. Burkholderia puraquae sp. nov., a novel species of the Burkholderia cepacia complex isolated from hospital settings and agricultural soils. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2018; 68(1):14–20. DOI: 10.1099/ijsem.0.002293..
DOI: 10.1099/ijsem.0.002293

Blumenscheit C., Pfeifer Y., Werner G., John C., Schneider A., Lasch P., Doellinger J. Unbiased antimicrobial resistance detection from clinical bacterial isolates using proteomics. bioRxiv. 2020. DOI: 10.1101/2020.11.17.386540..
DOI: 10.1101/2020.11.17.386540

Dieckmann R., Hammerl J.A., Hahmann H., Wicke A., Kleta S., Dabrowski P.W., Nitsche A., Stämmler M., Al Dahouk S., Lasch P. Rapid characterisation of Klebsiella oxytoca isolates from contaminated liquid hand soap using mass spectrometry, FTIR and Raman spectroscopy. Faraday Discuss. 2016; 187:353–75. DOI: 10.1039/c5fd00165j..
DOI: 10.1039/c5fd00165j

Daumas A., Alingrin J., Ouedraogo R., Villani P., Leone M., Mege J.-L. MALDI-TOF MS monitoring of PBMC activation status in sepsis. BMC Infect. Dis. 2018; 18(1):355. DOI: 10.1186/s12879-018-3266-7..
DOI: 10.1186/s12879-018-3266-7

Lasch P., Wahab T., Weil S., Pályi B., Tomaso H., Zange S., Kiland Granerud B., Drevinek M., Kokotovic B., Wittwer M., Pflüger V., Di Caro A., Stämmler M., Grunow R., Jacob D. Identification of highly pathogenic microorganisms by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry: results of an interlaboratory ring trial. J. Clin. Microbiol. 2015; 53(8):2632–2640. DOI: 10.1128/JCM.00813-15..
DOI: 10.1128/JCM.00813-15

Cheng W.C., Jan I.S., Chen J.M., Teng S.H., Teng L.J., Sheng W.H., Hsueh P.R. Evaluation of the Bruker Biotyper matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry system for identification of blood isolates of Vibrio species. J. Clin. Microbio. 2015; 53(5):1741–1744. DOI: 10.1128/JCM.00105-15..
DOI: 10.1128/JCM.00105-15

Rychert J., Creely D., Mayo-Smith L.M., Calderwood S.B., Ivers L.C., Ryan E.T., Boncy J., Qadri F., Ahmed D., Ferraro M.J., Harris J.B. Evaluation of matrix-assisted laser desorption ionization– time of flight mass spectrometry for identification of Vibrio cholerae. J. Clin. Microbiol. 2015; 53(1):329–331. DOI: 10.1128/JCM.02666-14..
DOI: 10.1128/JCM.02666-14

Балахонов С.В., Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Куликалова Е.С., Остяк А.С. MALDI-TOF масс-спектрометрическое определение видовой принадлежности патогенов в совершенствовании эпидемиологического надзора за опасными инфекционными болезнями. Бактериология. 2016; 1(1):88–94. DOI: 10.20953/2500-1027-2016-1-88-94..
DOI: 10.20953/2500-1027-2016-1-88-94

Миронова Л.В., Басов Е.А., Афанасьев М.В., Хунхеева Ж.Ю., Миткеева С.К., Ганин В.С., Урбанович Л.Я., Куликалова Е.С., Гольдапель Э.Г., Балахонов С.В. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ с молекулярно-генетической идентификацией Vibrio spp. в системе мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 19(6):27–36.

Афанасьев М.В., Остяк А.С., Балахонов С.В. Апробация метода масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией для идентификации возбудителя чумы. Клиническая лабораторная диагностика. 2014; 8:39–43.

Wittwer M., Heim J., Schär M., Dewarrat G., Schürch N. Tapping the potential of intact cell mass spectrometry with a combined data analytical approach applied to Yersinia spp.: detection, differentiation and identification of Y. pestis. Syst. Appl. Microbiol. 2011; 349(1):12–19. DOI: 10.1016/j.syapm.2010.11.006..
DOI: 10.1016/j.syapm.2010.11.006

Rouffaer L.O., Baert K., Van den Abeele A.M., Cox I., Vanantwerpen G., De ZutterL., Strubbe D., Vranckx K., Lens L., Haesebrouck F., Delmée M., Pasmans F., Martel A. Low prevalence of human enteropathogenic Yersinia spp. in brown rats (Rattus norvegicus) in Flanders. PLoS One. 2017; 12(4):e0175648. DOI: 10.1371/journal.pone.0175648..
DOI: 10.1371/journal.pone.0175648

Guliev R.R., Suntsova A.Y., Vostrikova T.Y., Shchegolikhin A.N., Popov D.A., Guseva M.A., Shevelev A.B., Kurochkin I.N. Discrimination of Staphylococcus aureus strains from coagulase-negative staphylococci and other pathogens by Fourier transform infrared spectroscopy. Anal. Chem. 2020; 92(7):4943–4948. DOI: 10.1021/acs.analchem.9b05050..
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b05050

Cuénod A., Foucault F., Pflüger V., Egli A. Factors associated with MALDI-TOF mass spectral quality of species identification in clinical routine diagnostics. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2021; 11:646648. DOI: 10.3389/fcimb.2021.646648..
DOI: 10.3389/fcimb.2021.646648

Morel F., Jacquier H., Desroches M., Fihman V., Kumanski S., Cambau E., Decousser J.W., Berçot B. Use of Andromas and Bruker MALDI-TOF MS in the identification of Neisseria. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2018; 37(12):2273–2277. DOI: 10.1007/s10096-018-3368-6..
DOI: 10.1007/s10096-018-3368-6

Lasch P., Drevinek M., Nattermann H., Grunow R., Stämmler M., Dieckmann R., Schwecke T., Naumann D. Characterization of Yersinia using MALDI-TOF mass spectrometry and chemometrics. Anal.Chem. 2010; 82(20):8464–8475. DOI: 10.1021/ac101036s..
DOI: 10.1021/ac101036s

Балахонов С.В., Афанасьев М.В., Шестопалов М.Ю., Остяк А.С., Витязева С.А., Корзун В.М., Вержуцкий Д.Б., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Денисов А.В., Ивженко Н.И., Рождественский Е.Н., Висков Е.Н., Фомина Л.А. Первый случай выделения Yersinia pestis subsp. Pestis в Алтайском горном природном очаге чумы. Сообщение 1. Микробиологическая характеристика, молекулярно-генетическая и масс-спектрометрическая идентификация изолята. Проблемы особо опасных инфекций. 2013;1:60–65.DOI: 10.21055/0370-1069-2013-1-60-65..
DOI: 10.21055/0370-1069-2013-1-60-65

Eddabra R., Prévost G., Scheftel J.M. Rapid discrimination of environmental Vibrio by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Microbiol. Res. 2012; 167(4):226–230. DOI: 10.1016/j.micres.2011.09.002..
DOI: 10.1016/j.micres.2011.09.002

Emami K., Askari V., Ullrich M., Mohinudeen K., Anil A.C., Khandeparker L., Burgess J.G., Mesbahi E. Characterization of bacteria in ballast water using MALDI-TOF mass spectrometry. PloS One. 2012; 7(6):e38515. DOI: 10.1371/journal.pone.0038515..
DOI: 10.1371/journal.pone.0038515

López-Ramos I., Hernández M., Rodríguez-Lázaro D., Gutiérrez M.P., Zarzosa P., Orduña A., March G.A. Quick identification and epidemiological characterization of Francisella tularensis by MALDI-TOF mass spectrometry. J. Microbiol. Methods. 2020; 177:106055.

Seibold E., Maier T., Kostrzewa M., Zeman E., Splettstoesser W.D. Identification of Francisella tularensis by whole-cell matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry: fast, reliable, robust, and cost-effective differentiation on species and subspecies levels. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(4):1061–9. DOI: 10.1128/JCM.01953-09..
DOI: 10.1128/JCM.01953-09

Müller W., Hotzel H., Otto P., Karger A., Bettin B., Bocklisch H., Braune S., Eskens U., Hörmansdorfer S., Konrad R., Nesseler A., Peters M., Runge M., Schmoock G., Schwarz B.A., Sting R., Myrtennäs K., Karlsson E., Forsman M., Tomaso H. German Francisella tularensis isolates from European brown hares (Lepus europaeus) reveal genetic and phenotypic diversity. BMC Microbiol. 2013; 13:61. DOI: 10.1186/1471-2180-13-61..
DOI: 10.1186/1471-2180-13-61

Ульшина Д.В., Еременко Е.И., Ковалев Д.А., Рязанова А.Г., Кузнецова И.В., Аксенова Л.Ю., Семенова О.В., Бобрышева О.В., Сирица Ю.В., Куличенко А.Н. Выявление особенностей масс-спектров белковых экстрактов споровой и вегетативной форм возбудителя сибирской язвы методом времяпролетной масс-спектрометрии. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; 6:66–72. DOI: 10.36233/0372-9311-2018-6-66-72..
DOI: 10.36233/0372-9311-2018-6-66-72

Ульшина Д.В., Еременко Е.И., Ковалев Д.А., Рязанова А.Г., Кузнецова И.В., Аксенова Л.Ю., Семенова О.В., Бобрышева О.В., Сирица Ю.В., Куличенко А.Н. Выявление особенностей масс-спектров белковых экстрактов споровой и вегетативной форм возбудителя сибирской язвы методом времяпролетной масс-спектрометрии. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; 6:66–72. DOI: 10.36233/0372-9311-2018-6-66-72..
DOI: 10.36233 / 0372-9311-2018-6-66-72

Ульшина Д.В., Ковалев Д.А., Бобрышева О.В., Пономаренко Д.Г., Русанова Д.В., Ковалева Н.И., Куличенко А.Н. Применение времяпролетной масс-спектрометрии для диагностики бруцеллеза и межвидовой дифференциации штаммов Brucella spp. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2018; 7(4):15–24. DOI: 10.24411/2305-3496-2018-14002..
DOI: 10.24411/2305-3496-2018-14002