Joint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2012. Geneva: UNAIDS, 2012, pp. 103, A5.

Москвичева М.Г., Радзиховская М.В. Анализ мирового опыта противодействия эпидемии ВИЧ/СПИДА // Уральский медицинский журнал. 2016. № 4. С. 132–137. [Moskvicheva M.G., Radzikhovskaya M.V., Analysis of world experience of HIV/AIDS. Uraljskiyj Medicinskiyj Journal, 2016, No. 4, pp. 132–137 (In Russ.)].

Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек, 2014. 288 с. [Bobkova M.R. Drug resistance of HIV. Moscow: Chelovek, 2014, 288 p. (In Russ.)].

Korber B., Muldoon M., Theiler J., Gao F., Gupta R., Lapedes A., Hahn B.H., Wolinsky S., Bhattacharya T. Timing the ancestor of the HIV-1 pandemic strains. Science, 2000, Vol. 288 (5472), рр. 1789–1796.

Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004. AIDS, 2006, Vol. 20 (16), рр. 13–23.

Kiwanuka N., Laeyendecker O., Robb M., Kigozi G., Arroyo M., McCutchan F. et al. Effect of human immunodeficiency virus Type 1 (HIV-1) subtype on disease progression in persons from Rakai, Uganda, with incident HIV-1 infection. J. Infect. Dis., 2008, Vol. 197, pp. 707–713.

Baeten J.M., Chohan B., Lavreys L., Chohan V., McClelland R.S., Certain L. HIV-1 subtype D infection is associated with faster disease progression than subtype A in spite of similar plasma HIV-1 loads. J. Infect Dis., 2007, Vol. 195, рр. 1177–1180.

Kiwanuka N., Laeyendecker O., Quinn T.C., Wawer M.J., Shepherd J., Robb M. HIV-1 subtypes and differences in heterosexual HIV transmission among HIV-discordant couples in Rakai, Uganda. AIDS, 2009, Vol. 23, рр. 2479–2484.

Renjifo B., Gilbert P., Chaplin B., Msamanga G., Mwakagile D., Fawzi W. Preferential in-utero transmission of HIV-1 subtype C as compared to HIV-1 subtype A or D. AIDS, 2004, Vol. 18, рр. 1629–1636.

Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. 2006. Global trends in molecular epidemiology of HIV-1 during 2000–2007. AIDS, 2011, Vol. 25 (5), рр. 679–689.

Dineke Frentz, Annemarie M.J. Wensing, Jan Albert, Dimitrios Paraskevis, Ana B. Abecasis, Osamah Hamouda, Louise B. Jörgensen, Claudia Kücherer, Daniel Struck, Jean-Claude Schmit, Birgitta Åsjö, Claudia Balotta, Danail Beshkov, Ricardo J. Camacho, Bonaventura Clotet, Suzie Coughlan, Stéphane De Wit, Algirdas Griskevicius, Zehava Grossman, Andrzej Horban, Tatjana Kolupajeva, Klaus Korn, Leondios G. Kostrikis, Kirsi Liitsola, Marek Linka, Claus Nielsen, Dan Otelea, Roger Paredes, Mario Poljak, Elisabeth Puchhammer-Stöckl, Anders Sönnerborg, Danica Stanekova, Maja Stanojevic, Anne-Mieke Vandamme, Chales A.B. Boucher, David A.M.C. Van de Vijver. Limited cross-border infections in patients newly diagnosed with HIV in Europe. Retrovirology, 2013, Vol. 10, рр. 36.

Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В., Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю., Бобкова М.Р. Проблемы субтипирования ВИЧ-1 на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010. Т. 2, № 3. С. 42–48. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Vasilyev A.V., Laga V.Yu., Grezina L.A., Volova L.Yu., Bobkova M.R. Problems of subtyping of HIV-1 on the base of pol gene and ways of their permission. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2010, Vol. 2, No. 3, pp. 42–48 (In Russ.)].

Беляков Н.А., Розенталь В.В., Дементьева Н.Е., Виноградова Т.Н., Сизова Н.В. Моделирование и общие закономерности циркуляции субтипов и рекомбинантных форм ВИЧ // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 7–18. [Belyakov N.A., Rozental V.V., Dementeva N.E., Vinogradova T.N., Sizova N.V. Mathematical modelling and general trends of circulation of HIV subtypes and recombinant forms. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 7–18 (In Russ.)].

Neogi U., Bontell I., Shet A., De Costa A., Gupta S., Diwan V., Laishram R.S., Wanchu A., Ranga U., Banerjea A.C., Sönnerborg A. Molecular Epidemiology of HIV-1 Subtypes in India: Origin and Evolutionary History of the Predominant Subtype C. PLoS One, 2012, Vol. 7 (6), рр. e39819.

Carr J.K., Torimiro J.N., Wolfe N.D., Eitel M.N., Kim B., Sanders-Buell E., Jagodzinski L.L., Gotte D., Burke D.S., Birx D.L., McCutchan F.E. The AG recombinant IbNG and novel strains of group M HIV-1 are common in Cameroon. Virology, 2001, Vol. 20, No. 286 (1), рр. 168–181.

Chan L.G., Ho M.J., Kaur P., Singh J., Ng O.T., Lee C.C., Leo Y.S., Carvalhal A. Differences in clinical and psychiatric outcomes between prevalent HIV-1 molecular subtypes in a multiethnic Southeast Asian sample. Gen. Hosp. Psychiatry, 2016, Vol. 38, рр. 4–8.

Hughes G.J., Fearnhill E., Dunn D., Lycett S.J., Rambaut A., Leigh Brown A.J. Molecular Phylodynamics of the Heterosexual HIV Epidemic in the United Kingdom. PLoS Pathog., 2009, Vol. 5 (9), рр. e1000590.

Neogi U., Häggblom A., Santacatterina M., Bratt G., Gisslén M., Albert J., Sonnerborg A. Temporal Trends in the Swedish HIV-1 Epidemic: Increase in Non-B Subtypes and Recombinant Forms over Three Decades. PLoS One, 2014, Vol. 9 (6), рр. e99390.

Paraskevis D., Pybus O., Magiorkinis G., Hatzakis A., Wensing A.M., van de Vijver D.A., Albert J., Angarano G., Asjo B., Balotta C. Tracing the HIV-1 subtype B mobility in Europe: a phylogeographic approach. Retrovirology, 2009, Vol. 6, рр. 49.

Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology. AIDS Res. Hum. Retrov., 2015, Vol. 31 (6), рр. 608–614.

Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологи ческий анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36. [Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukovicin D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasiljev A.V., Tumanov A.S., Voroncova G.A., Kuznecova A.V., Loyjfman E.A., Starukhina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Questions of Virology. 2014, No. 4, pp. 31–36 (In Russ.)].

Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Дельгадо Е., Вега И., Фернандес-Гарсия А., Перес-Альварес Л., Корнилаева Г.В., Пронин А.Ю., Жернов Ю.В., Томсон М.М., Бобкова М.Р., Карамов Э.В. Стремительное распространение циркулирующей рекомбинантной формы CRF02-AG ВИЧ-1 на территории России и сопредельных стран // Вопросы вирусологии. 2015. Т. 60, № 6. С. 14–19. [Moskaleyjchik F.F., Laga V.Yu., Deljgado E., Vega I., Fernandes-Garsiya A., Peres-Aljvares L., Kornilaeva G.V., Pronin A.Yu., Zhernov Yu.V., Tomson M.M., Bobkova M.R., Karamov Eh.V. The rapid expansion of circulating recombinant form, CRF02-AG HIV-1 on the territory of Russia and adjacent countries. Questions of Virology, 2015, Vol. 60, No. 6, pp. 14–19 (In Russ.)].

Суханова А.Л., Казеннова Е.В., Рудинский Н.И., Михайлович В.М., Грядунов Д.А., Будилов А.В., Булавкина М.А., Weber J.N., Покровский В.В., Бобков А.Ф. Генетическая изменчивость области, кодирующей протеазу, у изолятов ВИЧ-1 подтипа А и рекомбинантов CRF03_AB на территории СНГ // Вопросы вирусологии. 2004. Т. 49, № 6. С. 4–10. [Sukhanova A.L., Kazennova E.V., Rudinskiyj N.I., Mikhayjlovich V.M., Gryadunov D.A., Budilov A.V., Bulavkina M.A., Weber J.N., Pokrovskiyj V.V., Bobkov A.F. Voprosih virusologii, 2004, Vol. 49, No. 6, pp. 4–10 (In Russ.)].

Geretti A.M., Harrison L., Green H., Sabin C., Hill T., Fearnhill E. et al. Effect of HIV-1 subtype on virologic and immunologic response to starting highly active antiretroviral therapy. Clin. Infect. Dis., 2009, Vol. 48, рр. 1296–1305.

Martinez-Cajas J.L., Pai N.P., Klein M.B., Wainberg M.A. Differences in resistance mutations among HIV-1 non-subtype B infections: a systematic review of evidence (1996–2008). J. Int. AIDS Soc., 2009, Vol. 12. рр. 11.

Бобкова М.Р. История и некоторые результаты генотипирования ВИЧ в России // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. № 4. С. 7–16. [Bobkova M.R. History and some results of HIV genotyping in Russia. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, No. 4, pp. 7–16 (In Russ.)].

Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol., 2011, Vol. 28 (10), рр. 2731–2739.

Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987–2009 гг. // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 1. С. 27–36. [Smolskaya T.T., Ogurtsova S.V. Overview of the status of HIV epidemic in the North-West region of Russia in the years 1987–2009. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 1, pp. 27–36 (In Russ.)].

Беляков Н.А., Семенов А.В., Коновалова Н.В., Огурцова С.В., Светличная Ю.С., Эсауленко Е.В., Асадуллаев М.Р., Амозов А.М., Белов С.В., Гусев Д.А., Карпунов А.А., Ковеленов А.Ю., Мельникова Т.Н., Поган С.С., Попова Е.С., Сивачева И.Л., Черкес Н.Н., Пантелеев А.М. ВИЧ-инфекция и коморбидные состояния в Северо-Западном федеральном округе Российской Федерации в 2015 году: аналитический обзор. СПб.: ФБУН «НИИЭМ имени Пастера», 2016. 48 с. [Belyakov N.A., Semenov A.V., Konovalova N.V., Ogurtsova S.V., Svetlichnaya Yu.S., Ehsaulenko E.V., Asadullaev M.R., Amozov A.M., Belov S.V., Gusev D.A., Karpunov A.A., Kovelenov A.Yu., Meljnikova T.N., Pogan S.S., Popova E.S., Sivacheva I.L., Cherkes N.N., Panteleev A.M. HIV infection and comorbid conditions in the North-West Federal district of the Russian Federation in 2015: an analytical review. Saint-Petersburg: Saint-Petersburg Pasteur Institute, 2016, 48 p. (In Russ.)].

Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3, № 4. С. 34–44. [Dementjeva N.E., Sizova N.V., Lisicina Z.N., Maklakova V.A., Krutickaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–44 (In Russ.)].

Рахманова А.Г., Захарова Н.Г., Торопов С.Э., Степанова Е.В., Рассохин В.В. Формирование резистентности к высокоактивной антиретровирусной терапии у ВИЧ-инфицированных пациентов // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 55–63. [Rakhmanova A.G., Zakharova N.G., Toropov S.Eh., Stepanova E.V., Rassokhin V.V. Development of HIV resistance to highly active antiretroviral therapy. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 2, pp. 55–63 (In Russ.)].

Rumyantseva O.A., Olkhovskiy I.A., Malysheva M.A., Ruzaeva L.A., Vasiliev A.V., Kazennova E.V., Bobkova M.R., Lukashov V.V. Epidemiological networks and drug resistance of HIV type 1 in Krasnoyarsk region, Russia. AIDS Res. Hum. Retrov., 2009, Vol. 25 (9), рр. 931–936.

Bobkov A., Kazennova E., Selimova L., Bobkova M., Khanina T., Ladnaya N., Kravchenko A., Pokrovsky V., Cheingsong-Popov R., Weber J. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants. AIDS Res. Hum. Retrov., 1998, Vol. 14, No. 8. рр. 669–676.

Smolskaya T., Liitsola K., Zetterberg V., Golovanova E., Kevlova N., Konovalova N., Sevastianova K., Brummer-Korvenkontio H., Salminen M. HIV epidemiology in the Northwestern Federal District of Russia: Dominance of HIV type 1 subtype A. AIDS Res. Hum. Retrov., 2006, Vol. 22 (11), рр. 1074–1080.

Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б., Мещерякова Ю.В., Черноусова Н.Я., Гашникова Н.М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии, иммунобиологии. 2012. № 6. С. 45–52. [Bogachev V.V., Totmenin A.V., Barihshev P.B., Metheryakova Yu.V., Chernousova N.Ya., Gashnikova N.M. Molecular genetic characterization of HIV-1 subtypes A and b allocated on the territory of Novosibirsk region. Journal of Microbiology, Еpidemiology and Immunobiology, 2012, No. 6, pp. 45–52 (In Russ.)].

Abecasis A.B., Wensing A.M.J., Paraskevis D., Vercauteren J., Theys K. HIV-1 subtype distribution and its demographic determinants in newly diagnosed patients in Europe suggest highly compartmentalized epidemics. Retrovirology, 2013, Vol. 10, No. 1, рр. 7.

Захарова Н.Г., Дворак С.И., Плавинский С.Л., Торопов С.Э., Рассохин В.В., Беляков Н.А. Причины неблагоприятных исходов у больных с ВИЧ-инфекцией, принимавших ВААРТ. Часть II // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 4. С. 52–63. [Zakharova N.G., Dvorak S.I., Plavinskiyj S.L., Toropov S.Eh., Rassokhin V.V., Belyakov N.A. The causes of unfavorable outcomes among patients taking Haart. Part II. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, Vol. 7, No. 4, pp. 52–63 (In Russ.)].

Hicks P.L., Mulvey K.P., Chander G., Fleishman J.A., Josephs J.S., Korthuis P.T., Hellinger J., Gaist P., Gebo K.A. The impact of illicit drug use and substance abuse treatment on adherence to HAART. AIDS Care, 2007, Vol. 19, рр. 1134–1140.