Цель исследования.Цель исследования: проанализировать уровень, структуру лекарственной устойчивости и мутаций резистентности во фрагментах гена pol ВИЧ-1, кодирующих протеазу и обратную транскриптазу, к антиретровирусным препаратам среди ВИЧ-инфицированных пациентов, не имеющих опыта антиретровирусной терапии.Материалы и методы.Материалы и методы. Выполнено исследование 1560 нуклеотидных последовательностей фрагментов гена pol, кодирующих протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1, выделенных от ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта антиретровирусной терапии из всех Федеральных округов Российской Федерации с первым положительным результатом иммунного блоттинга в 1998–2017 гг. Нуклеотидные последовательности участков генома ВИЧ-1 анализировали на наличие мутаций резистентности и уровня прогностической лекарственной устойчивости к антиретровирусным препаратам двумя алгоритмами –согласно алгоритму Стэндфордского университета, оценивали основные мутации лекарственной устойчивости (MDRM) и, используя инструмент CPR, оценивали мутации из листа SDRM 2009 г.Результаты.Результаты. Уровень распространения мутаций, ассоциированных с прогностической лекарственной устойчивостью низкого, среднего и высокого уровня, составил 11,1[%]. Наиболее высокая распространенность лекарственной устойчивости обнаружена к препаратам класса ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (рилпивирин, невирапин, эфавиренз). Уровень распространенности передаваемой лекарственной устойчивости, связанной с мутациями из списка SDRM, составил 5,3[%], что классифицируется ВОЗ как умеренный. Однако следует отметить, что с момента широкомасштабного применения антиретровирусных препаратов в России наблюдается тенденция к постепенному росту уровня передаваемой лекарственной устойчивости, и в 2016 году он уже достиг 6,1[%].Заключение.Заключение. Полученные данные демонстрируют необходимость осуществления регулярного надзора за уровнем распространения лекарственной устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам среди наивных пациентов в Российской Федерации.
Joint United Nations Programme (UNAIDS). 90-90-90 An ambitious treatment target to help end the AIDS epidemic. Geneva, 2014, 33 p. URL: http://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf (October 2014).http://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/90-90-90_en_0.pdf
Guidelines on the public health response to pretreatment HIV drug resistance. Geneva: World Health Organization, 2017, 84 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf?sequence=1 (July 2017).https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/255880/9789241550055-eng.pdf?sequence=1
WHO/HIVResNet HIV drug resistance laboratory operational framework. Geneva: World Health Organization, 2017, 73 p. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/259731/9789241512879-eng.pdf?sequence=1 (December 2017).https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/259731/9789241512879-eng.pdf?sequence=1
Fokam J., Takou D., Santoro M.M., Akonie H.Z., Kouanfack C., Ceccherini-Silberstein F., Colizzi V. et al. Population-based surveillance of HIV- 1 drug resistance in Cameroonian adults initiating antireviral therapy according to the World Health Organization guidelines. AIDS Res. Hum. Retrovir., 2016, Vol. 32, No. 4, pp. 329–333.
Quinn T.C. HIV epidemiology and the effects of antiviral therapy on long-term consequences. AIDS, 2008, Vol. 22, Suppl. 3, pp. S7–S12.
Ладная Н.Н., Богословская Е.В., Суханова А.Л. и др. Распространенность штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам, передающихся от пациента к пациенту на территории шести субъектов России // Сб. трудов 6-й Всероссийской научно-практической кон- ференции с международным участием «Молекулярная диагностика — 2007». 2007. Т. 1. С. 121–123. [Ladnaya N.N., Bogoslovskaya E.V., Suhanova A.L. et al. The prevalence of HIV strains resistant to antiretroviral drugs, transmitted from patient to patient in the territory of six subjects of Russia. Proceedings of the 6th All-Russian Sientific-Practical Conference with international participation «Molecular Diagnostics — 2007», 2007, Vol. 1, pp. 121–123 (In Russ.)].
Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ к антиретровирусным препаратам в Приволжском федеральном округе // Медицинский альманах. 2016. T. 3, № 43. С. 93–95. [Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Peksheva O.Yu. Analysis of the prevalence of primary resistance of HIV to antiretroviral drugs in the Volga Federal District. Medical almanac, 2016, Vol. 3, No. 43, pp. 148–151 (In Russ.)].
Lapovok I., Murzakova A., Lopatukhin A., Kireev D., Kazennova E., Bobkova M. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations among ART-naive patients in Russia from 2005 to 2015. Proceedings of 14th European Meeting on HIV & Hepatitis. Rev. Antivir. Ther. Infect. Dis., 2016, Vol. 4, pp. 83–84.
Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. T. 3, № 4. C. 34–43. [Dement’eva N.Ye., Sizova N.V., Lisitsyna Z.N., Maklakova V.A., Krutitskaya L.I., Belyakov N.A. Analysis of HIV subtypes and dru-resistant variants circulating in Saint-Petersburg. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2011, Vol. 3, No. 4, pp. 34–43 (In Russ.)].
Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D. et al. Drug Resistance Mutations for Surveillance of Transmitted HIV-1 Drug-Resistance: 2009. PLoS One, 2009, Vol. 4, No. 3, pp. 1–8 (e4724).
Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Infect. Genet. Evol., 2016, pp. 150–158.
Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Васильев А.В., Бобкова М.Р. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 4. С. 44–51. [Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Vasilyev A.V., Bobkova M.R. Natural polymorphisms of HIV-1 IDU-A variant pol gene. HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, Vol. 4, No. 4, pp. 44–51 (In Russ.)].
Покровская А.В., Козырина Н.В., Гущина Ю.Ш., Юрин О.Г., Суворова З.К., Покровский В.В. Социально-демографический портрет пациента, живущего с ВИЧ и посещающего центры СПИД в России // Терапевтический архив. 2016. Т. 88, № 11. С. 12–16. [Pokrovskaya A.V., Kozyrina N.V., Gushchina Yu.Sh., Yurin O.G., Suvorova Z.K., Pokrovsky V.V. Socio-demographic portrait of a patient living with HIV who visits AIDS centers in Russia. Therapeutic archive, 2016, Vol. 88, No. 11, pp. 12–16 (In Russ.)].
Bennett D.E., Myatt M., Bertagnolio S., Sutherland D., Gilks C.F. Recommendations for surveillance of transmitted HIV drug resistance in countries scaling up antiretroviral treatment. Antivir. Ther., 2008, Vol. 13, Suppl. 2, pp. 25–36.