RuSIDA: онлайн-ресурс для сбора, хранения и анализа эпидемиолого-демографических и клинико-лабораторных данных пациентов

СтатьяВИЧ ИНФ ИММУНОСУПР. 2022; Т. 14, № 4: 49–58. DOI:10.22328/2077-9828-2022-14-4-49-58

Кузнецова А.И.^[1]

Бобков В.Г.^[1]

Лебедев А.В.^[1]

Туманов А.С.^[1]

Ким К.В.^[1]

Чайковская Н.Э.^[2]

Чудновский А.Г.^[3]

Чарушин А.Н.^[4]

Пронин А.Ю.^[5]

Дробышевская Е.В.^[5]

Шемшура А.Б.^[6]

Туркин А.В.^[7]

Ильина Е.А.^[8]

ШЕВЧЕНКО В.В.^[8]

Крылова Т.В.^[9]

Кириллова И.Л.^[9]

Бегма Е.Н.^[10]

Богатырева Т.И.^[10]

Проданова К.Г.^[10]

Скляр Л.Ф.^[11]

Казеннова Е.В.^[1]

Бобкова М.Р.^[1]

^[1]Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи (Москва)

^[2]«РГКонсалтинг»

^[3]Медицинская акционерная страховая компания (АО «МАКС-М»)

^[4]«Алмонд Консалтинг»

^[5]Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

^[6]КЦ профилактики и борьбы со СПИД

^[7]Вологодский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями

^[8]Алтайский краевой центр по профилактике и борьбе со СПИДом и инфекционными заболеваниями

^[9]Вологодская областная клиническая больница № 2, Центр профилактики и борьбы со СПИДом

^[10]Центр по профилактике и борьбе со СПИДом

^[11]Московский областной научно-исследовательский клинический институт имени М.Ф. Владимирского

Материалы и методы.Материалы и методы. При создании онлайн-инструмента в качестве образца были использованы разработки европейских коллег, применяемые для проведения многоцентрового исcледования EuroSIDA, включая перечень, алгоритмы сбора, хранения и выгрузки данных.Результаты и их обсуждение. Разработан русскоязычный онлайн-ресурс RuSIDA, размещенный на сайте http://hivgen.org/, предназначенный для выполнения указанных выше задач. Инструмент требует авторизированного доступа и был успешно апробирован при сборе данных ВИЧ-инфицированных пациентов в нескольких центрах СПИД РФ.Заключение.Заключение. Разработанный онлайн-ресурс RuSIDA может быть использован для ведения медицинских электронных карт, внутрилабораторных баз данных, а также для проведения эпидемиологического мониторинга различной нозологии и многоцентровых научных исследований.

«RuSIDA»

ВИЧ

онлайн-ресурс

Алгоритмы

Белки

Больные

ВИЧ

Врачи

Врачи-руководящие работники

Диагностика

Здравоохранение

История болезни

Крым

Лаборатории

Лейкозы

Методы

Москва

Московская область

Научные исследования

Работа

Российская Федерация

СПИД

Северо-Западный федеральный округ

Список

Электроны

Эпидемиологический мониторинг

Эпидемиология

Этническая принадлежность

Dash S., Shakyawar S.K., Sharma M., Kaushik S. Big data in healthcare: management, analysis and future prospects // J. Big. Data. 2019. Vol. 6. Р. 54. https://doi.org/10.1186/s40537-019-0217-0..
DOI: 10.1186/s40537-019-0217-0

Wang L., Alexander C.A. Big data analytics in medical engineering and healthcare: methods, advances and challenges // J. Med. Eng. Technol. 2020. Vol. 44, No. 6. Р. 267–283. doi: 10.1080/03091902.2020.1769758..
DOI: 10.1080/03091902.2020.1769758

Pipeline Gilead. 2022. Available online at: https://www.gilead.com/science-and-medicine/pipeline (accessed august 19, 2022).https://www.gilead.com/science-and-medicine/pipeline

Schürmann D., Rudd D.J., Zhang S. De Lepeleire I., Robberechts M., Friedman E., Keicher C., Hüser A., Hofmann J., Grobler J.A., Stoch S.A., Iwamoto M., Matthews R.P. Safety, pharmacokinetics, and antiretroviral activity of islatravir (ISL, MK-8591), a novel nucleoside reverse transcriptase translocation inhibitor, following single-dose administration to treatment-naive adults infected with HIV-1: an open-label, phase 1b, consecutive-panel trial // Lancet HIV. 2020. Vol. 7, No. 3. Р. e164-e172. doi: 10.1016/S2352-3018(19)30372-8..
DOI: 10.1016/S2352-3018(19)30372-8

ClinicalTrials.gov.2022. Study Evaluating the Efficacy, Safety, and Tolerability of Switching to Long-acting Cabotegravir Plus Long-acting Rilpivirine From Current Antiretroviral Regimen in Virologically Suppressed HIV-1-infected Adults — Full Text View — ClinicalTrials.gov (accessed Аugust 19, 2022).

Kim J., Vasan S., Kim J.H., Ake J.A. Current approaches to HIV vaccine development: a narrative review // J. Int. AIDS Soc. 2021. Vol. 7. Р. e25793. doi: 10.1002/jia2.25793..
DOI: 10.1002/jia2.25793

Winias S., Radithia D., Savitri Ernawati D. Neuropathy complication of antiretroviral therapy in HIV/AIDS patients // Oral Dis. 2020. Vol. 1. Р. 149–152. doi: 10.1111/odi.13398..
DOI: 10.1111/odi.13398

Silva B.F., Peixoto G., da Luz S.R. de Moraes S., Peres S.B. Adverse effects of chronic treatment with the Main subclasses of highly active anti-retroviral therapy: a systematic review // HIV Med. 2019. Vol. 7. Р. 429–438. doi: 10.1111/hiv.12733..
DOI: 10.1111/hiv.12733

Santoro M.M., Armenia D., Teyssou E. Santos J.R., Charpentier C., Lambert-Niclot S., Antinori A., Katlama C., Descamps D., Perno C.F., Calvez V., Paredes R., Ceccherini-Silberstein F., Marcelin A.G. Virological efficacy of switch to DTG plus 3TC in a retrospective observational cohort of suppressed HIV-1 patients with or without past M184V — The LAMRES Study // J. Glob. Antimicrob. Resist. 2022. Vol. S22137165(22)00189-8. doi: 10.1016/j.jgar.2022.07.022..
DOI: 10.1016/j.jgar.2022.07.022

Chastain D., Badowski M., Huesgen E. Pandit N.S., Pallotta A., Michienzi S. Optimizing Antiretroviral Therapy in Treatment-Experienced Patients Living with HIV: A Critical Review of Switch and Simplification Strategies. An Opinion of the HIV Practice and Research Network of the American College of Clinical Pharmacy. J Int Assoc Provid AIDS Care. 2019. Vol. 18. Р. 2325958219867325. doi: 10.1177/2325958219867325..
DOI: 10.1177/2325958219867325

Feng Q., Zhou A., Zou H., Ingle S., May M.T., Cai W., Cheng C.Y., Yang Z., Tang J. Quadruple versus triple combination antiretroviral therapies for treatment naive people with HIV: systematic review and meta-analysis of randomised controlled trials // BMJ. 2019. Vol. 366. Р. l4179. doi: 10.1136/bmj.l4179..
DOI: 10.1136/bmj.l4179

Boyd M.A., Boffito M., Castagna A. Estrada V. Rapid initiation of antiretroviral therapy at HIV diagnosis: definition, process, knowledge gaps // HIV Med. 2019. Vol. 1. Р. 3–11. doi: 10.1111/hiv.12708..
DOI: 10.1111/hiv.12708

Lau J.S.Y., Smith M.Z., Lewin S.R. McMahon J.H. Clinical trials of antiretroviral treatment interruption in HIV-infected individuals // AIDS. 2019. Vol. 33, No. 5. Р. 773–791. doi: 10.1097/QAD.0000000000002113..
DOI: 10.1097/QAD.0000000000002113

Nhean S., Tseng A., Back D. The intersection of drug interactions and adverse reactions in contemporary antiretroviral therapy // Curr. Opin. HIV AIDS. 2021. Vol. 16, No. 6. Р. 292–302. doi: 10.1097/COH.0000000000000701.
DOI: 10.1097/COH.0000000000000701

Cadet M.J. Antiretroviral therapies and corticosteroids: Drug-drug interactions // Nurse Pract. 2021. Vol. 46, No. 12. Р. 40–47. doi: 10.1097/01.NPR.0000798224.30305.d1..
DOI: 10.1097/01.NPR.0000798224.30305.d1

Bukkems V.E., Colbers A., Marzolini C. Molto J., Burger D.M. Drug-Drug Interactions with Antiretroviral Drugs in Pregnant Women Living with HIV: Are They Different from Non-Pregnant Individuals? // Clin. Pharmacokinet. 2020. Vol. 59, No. 10. Р. 1217–1236. doi: 10.1007/s40262020-00914-x..
DOI: 10.1007/s40262020-00914-x

Areri H.A., Marshall A., Harvey G. Interventions to improve self-management of adults living with HIV on Antiretroviral Therapy: A systematic review // PLoS ONE. 2020. Vol. 15, No. 5. Р. e0232709. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0232709..
DOI: 10.1371/journal.pone.0232709

Euresist Data Analysis — database. Accessed August 03, 2022.

Laut K., Kirk O., Rockstroh J. et al. The EuroSIDA study: 25 years of scientific achievements // HIV Med. 2020. Vol. 2. Р. 71–83. doi: 10.1111/hiv.12810..
DOI: 10.1111/hiv.12810

Rosen-Zvi M., Altmann A., Prosperi M. Aharoni E., Neuvirth H., Sönnerborg A., Schülter E., Struck D., Peres Y., Incardona F., Kaiser R., Zazzi M., Lengauer T. Selecting anti-HIV therapies based on a variety of genomic and clinical factors // Bioinformatics. 2008. Vol. 24, No. 13. Р. i399-i406. doi: 10.1093/bioinformatics/btn141..
DOI: 10.1093/bioinformatics/btn141

Zazzi M., Incardona F., Rosen-Zvi M., Prosperi M., Lengauer T., Altmann A., Sonnerborg A., Lavee T., Schülter E., Kaiser R. Predicting response to antiretroviral treatment by machine learning: the EuResist project // Intervirology. 2012. Vol. 55, No. 2. Р. 123–127. doi: 10.1159/000332008..
DOI: 10.1159/000332008

Lawyer G., Altmann A., Thielen A., Zazzi M., Sönnerborg A., Lengauer T. HIV-1 mutational pathways under multidrug therapy // AIDS Res Ther. 2011. Vol. 8. Р. 26. doi: 10.1186/1742-6405-8-26..
DOI: 10.1186/1742-6405-8-26

Kuznetsova A., Lebedev A., Gromov K., Kazennova E., Zazzi M., Incardona F., Sönnerborg A, Bobkova M. Pre-existing singleton E138A muta-tions in the reverse transcriptase gene do not affect the efficacy of first-line antiretroviral therapy regimens using rilpivirine in human immunodeficiency virus-infected patients // Clinical case reports. 2022. Vol. 10, No. 2. Р. e05373. https://doi.org/10.1002/ccr3.5373..
DOI: 10.1002/ccr3.5373

Miranda M.N.S., Pingarilho M., Pimentel V., Martins M.D.R.O., Kaiser R., Seguin-Devaux C., Paredes R., Zazzi M., Incardona F., Abecasis A.B. Trends of Transmitted and Acquired Drug Resistance in Europe From 1981 to 2019: A Comparison Between the Populations of Late Presenters and Non-late Presenters // Front. Microbiol. 2022. Vol. 13. Р. 846943. doi: 10.3389/fmicb.2022.846943..
DOI: 10.3389/fmicb.2022.846943

Miranda M.N.S., Pingarilho M., Pimentel V. Martins M.D.R.O., Vandamme A.M., Bobkova M., Böhm M., Seguin-Devaux C., Paredes R., Rubio R., Zazzi M., Incardona F., Abecasis A. Determinants of HIV-1 Late Presentation in Patients Followed in Europe // Pathogens. 2021. Vol. 10, No. 7. Р. 835. doi: 10.3390/pathogens10070835..
DOI: 10.3390/pathogens10070835

Мызникова А.И., Куевда Д.А. Электронная база данных устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам // Материалы VII Всероссийской научно-практической конференции «Молекулярная диагностика». М., 2010. С. 49–52

Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. Т. 89, № 11. С. 44–49. doi: 10.17116/terarkh2017891144-49 (In Russ.)]..
DOI: 10.17116/terarkh2017891144-49 (In Russ.)]

Tarasova O., Rudik A., Kireev D., Poroikov V. RHIVDB: A Freely Accessible Database of HIV Amino Acid Sequences and Clinical Data of Infected Patients // Front. Genet. 2021. Vol. 12. Р. 679029. doi: 10.3389/fgene.2021.679029..
DOI: 10.3389/fgene.2021.679029

Standard Operating Procedure for data transfer in RESPOND, EuroSIDA, and CARE. Version 5.0. chip.dk. Accessed December 20, 2021.

Язык текста: Русский

ISSN: 2077-9828